공공투자관리센터는 대규모 재정투자사업에 대한 예비타당성 조사, 총사업비 관리를 위한 타당성재조사 등을 수행하고 있으며, 이러한 대규모 공공투자에 대한 사전·사후 타당성 검증을 통해 재정운용의 효율성 제고와 재정건전성 개선에 기여하고 있다.

민간투자사업을 보다 효율적으로 추진할 수 있도록 사업 추진 과정에서 타당성 분석 및 적격성조사, 사업제안서 평가, 자금 재조달 검토, 협상지원 및 분쟁조정 검토 등 주무관청에 대한 직접지원 업무를 수행하고 있다. 뿐만 아니라 민간투자사업에 대한 국내외 교육과 사업추진의 세부요령 및 정책개발 연구 등 사업 주무부처와 민간부문에 대한 정책 서비스를 제공하고 있다.

공공기관 사업에 대한 타당성을 평가하여 공공기관의 신규투자 결정 시 참고가 될 수 있도록 사업의 효율성 제고 및 공공기관의 재무건전성 확보에 기여하고 있다. 또한 2015년부터는 조세특례 에 대한 예비타당성조사와 심층평가를 수행하여 정책결정에 활용할 수 있도록 기여하고 있다.

공공투자관리센터는 민간투자제도 전반에 대한 교육 등을 통해 제도 및 관련 사업에 대한 이해 증진과 담당자의 업무 능력 향상을 지원하고 있다. 또한 OECD·WB·IMF·IDB·ADB 등 국제기구 와의 재정투자관리 및 민간투자 관련 협력사업·공동연구 추진, 국제회의·세미나 개최 또는 참여 등을 통해 국제적 논의에 활발히 참여하고 있다.